More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64442 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_64442  L-KDR aldolase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83008  Dihydrodipicolinate synthase  42.77 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57832  predicted protein  39.87 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.746726  normal  0.378562 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  33.09 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  33.02 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.632433 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  28.66 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.716956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  31 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  32.66 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  30.25 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02040  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.57 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  31.3 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  28.35 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  29.3 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.5 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02950  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  29.84 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.7 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.7 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.7 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  28.7 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  29.91 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.17 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  26.5 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.36 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  28.7 
 
 		 390 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.58 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  25.71 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  29.17 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  26.77 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 371 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1369  hypothetical protein  29.64 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  27.15 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.85 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.73 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  25.94 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  27.67 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2327  dihydrodipicolinate synthetase  27.13 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  28.75 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.51 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  30.42 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>