More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03990 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  739    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  38.87 
 
 		 335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.716956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  41.32 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  36.72 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.632433 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02950  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83008  Dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57832  predicted protein  31.29 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.746726  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  30.89 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64442  L-KDR aldolase  32.66 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  35.63 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02040  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.6 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  31 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  30.61 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  30.61 
 
 		 310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.46 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.39 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  30.49 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  33.04 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  33.63 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  33.48 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  33.86 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  33.86 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  33.07 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06029  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.634366 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.95 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  33.04 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 293 aa  103  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.27 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  30.83 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  29.03 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  37.97 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  33.63 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.68 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.98 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  33.18 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.4 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.14 
 
 		 313 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.98 
 
 		 304 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.39 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.39 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  30.29 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.37 
 
 		 305 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.39 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.37 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.32 
 
 		 295 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  31.89 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  29.39 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  30.93 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 309 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.16 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  30.5 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.31 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 306 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 306 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  27.76 
 
 		 306 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>