More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02040 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI02040  dihydrodipicolinate synthase, putative  100 
 
 
342 aa  707    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602219  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  38.05 
 
 
335 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.716956 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02950  conserved hypothetical protein  38.22 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  37.95 
 
 
309 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  36.65 
 
 
326 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  32.71 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.632433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
325 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57832  predicted protein  30.4 
 
 
315 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.746726  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64442  L-KDR aldolase  28.57 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83008  Dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  30.75 
 
 
296 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 
331 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  29.26 
 
 
299 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  26.43 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
295 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 
298 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.41 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
309 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.45 
 
 
313 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  25.54 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  29.66 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  26.2 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  28.29 
 
 
294 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  24.61 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  29.06 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  32.24 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  24.61 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  26.11 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  23.64 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  33.74 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  27.16 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  26.61 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  23.85 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  29.58 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  28.96 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  24.62 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.47 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  31.08 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  25.88 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  25.94 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.38 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  25.93 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1836  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  25.97 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  25.94 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  28.65 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  25.4 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  24.14 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.31 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.79 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  25.46 
 
 
297 aa  77  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1897  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  29.06 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  24.33 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  23.85 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  25.23 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1511  dihydrodipicolinate synthase  28.5 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140382  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  27.8 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  26.11 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  25.48 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  23.24 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>