More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83008 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_83008  Dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 317 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57832  predicted protein  58.04 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.746726  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64442  L-KDR aldolase  42.77 
 
 		 310 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  32.01 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  30.72 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.716956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  30.46 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.632433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02040  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.57 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.08 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  29.84 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02950  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  29.34 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.79 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.13 
 
 		 206 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  31.2 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.46 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.46 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.46 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.27 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.43 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  29.92 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.39 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  30.65 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  27.56 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  27.52 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  27.56 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  27.56 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>