More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57832 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57832  predicted protein  100 
 
 		 315 aa  637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.746726  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83008  Dihydrodipicolinate synthase  58.04 
 
 		 317 aa  381  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64442  L-KDR aldolase  39.87 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  28.77 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.716956 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10990  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G01230)  36.22 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.632433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00617  conserved hypothetical protein  35.95 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111559  normal  0.483621 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  30.04 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02040  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.4 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602219  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02950  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.6 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.89 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  29.36 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  29.22 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  27.48 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  28.84 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.93 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 293 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.39 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.86 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  29.54 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1199  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 371 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.42 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  29.36 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  27.11 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  28.45 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  27.34 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  27.62 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 290 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  26.25 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.86 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  30.04 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  26.97 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  29.26 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  26.75 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 290 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  23.62 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.54 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  27.31 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  25.37 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  28.39 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  27.64 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>