More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1978 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1917  dihydrodipicolinate synthetase  39.52 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  32.49 
 
 
331 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01503  Dihydrodipicolinate synthase-like protein AN1503 (DHDPS-like protein)(EC 4.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD77]  35.23 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.274468  normal  0.988674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.05 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 
291 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  37.01 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 
298 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 
298 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 
303 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 
290 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 
290 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  35.27 
 
 
291 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07929  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
326 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02859  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11920)  33.85 
 
 
335 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.716956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 
289 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.36 
 
 
301 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.79 
 
 
313 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 
289 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 
313 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  34.89 
 
 
290 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  34.89 
 
 
295 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 
290 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
290 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 
319 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 
289 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 
294 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 
291 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 
295 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 
297 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 
289 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 
290 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
291 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
291 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 
288 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 
292 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 
290 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 
297 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03990  conserved hypothetical protein  35.63 
 
 
359 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 
296 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 
294 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
292 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 
295 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
307 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 
295 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 
292 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 
294 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 
298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 
298 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 
293 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 
292 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
292 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
298 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 
292 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
292 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 
291 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
300 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 
298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 
298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
293 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 
296 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
294 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 
296 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.6 
 
 
308 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 
291 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 
298 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>