175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62019 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_62019  member of Set1p complex, histone methyl transferase  100 
 
 
367 aa  753    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.805326 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00065  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12370)  34.08 
 
 
364 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371171 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00180  histone lysine N-methyltransferase, putative  30.46 
 
 
424 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12699  predicted protein  27.12 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00642034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 
1163 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 
1196 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.33 
 
 
696 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.66 
 
 
1221 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28743  predicted protein  24.17 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.33 
 
 
947 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 
1236 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.93 
 
 
1652 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
1177 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1193 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  24.23 
 
 
516 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 
371 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.21 
 
 
1330 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 
1247 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  25 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 
1661 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.72 
 
 
1348 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  23.7 
 
 
1041 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.72 
 
 
564 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.31 
 
 
1711 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.34 
 
 
1242 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.61 
 
 
1474 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  23.77 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.97 
 
 
1686 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 
1760 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20 
 
 
698 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.49 
 
 
919 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.09 
 
 
1481 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 
1188 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 
477 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.21 
 
 
1357 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.61 
 
 
1004 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.14 
 
 
1039 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 
344 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  22.35 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
687 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.75 
 
 
1211 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.29 
 
 
740 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  19.9 
 
 
1262 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  22.73 
 
 
813 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23 
 
 
664 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 
840 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 
540 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.69 
 
 
1363 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.82 
 
 
1367 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.26 
 
 
1364 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 
1264 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 
1264 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.83 
 
 
1557 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.03 
 
 
675 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.97 
 
 
576 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.45 
 
 
1553 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.79 
 
 
1454 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 
1213 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  22.88 
 
 
1275 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 
1344 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.23 
 
 
1190 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.07 
 
 
677 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.95 
 
 
1858 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.22 
 
 
589 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  20.76 
 
 
1510 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.58 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
676 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.11 
 
 
505 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  22.26 
 
 
1416 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  23.7 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.92 
 
 
790 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01379  Putative uncharacterized proteinSONA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74224]  23.53 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.389246  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  31.25 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.01 
 
 
1552 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.73 
 
 
1609 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.45 
 
 
657 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  24.44 
 
 
618 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.23 
 
 
490 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04163  GBLP_NEUCR Guanine nucleotide-binding protein beta subunit-like protein (Cross-pathway control WD-repeat protein cpc-2)Gbeta like protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HGV7]  28 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 
1411 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006686  CND03830  conserved hypothetical protein  21.61 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.53 
 
 
682 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.46 
 
 
1240 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.13 
 
 
1190 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.41 
 
 
1856 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.11 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.74 
 
 
1188 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  23.47 
 
 
608 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.96 
 
 
596 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.75 
 
 
930 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  24.39 
 
 
473 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.65 
 
 
1623 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  21.86 
 
 
1209 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49529  predicted protein  24.07 
 
 
846 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.59 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65683  U3 snoRNP protein  23.75 
 
 
951 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  21.77 
 
 
1217 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>