196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00180 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00180  histone lysine N-methyltransferase, putative  100 
 
 
424 aa  872    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00065  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12370)  30.91 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371171 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62019  member of Set1p complex, histone methyl transferase  30.43 
 
 
367 aa  149  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.805326 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12699  predicted protein  31.94 
 
 
337 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00642034  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28743  predicted protein  32.05 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.04 
 
 
1221 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.03 
 
 
1163 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 
1552 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.86 
 
 
1901 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.05 
 
 
1474 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 
1190 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.42 
 
 
1652 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.05 
 
 
1213 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.34 
 
 
930 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.6 
 
 
1823 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  26.18 
 
 
522 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.09 
 
 
1617 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 
540 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 
1196 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.95 
 
 
1262 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 
1557 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  27.87 
 
 
534 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.39 
 
 
1789 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29215  predicted protein  25.17 
 
 
317 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.23 
 
 
1211 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.01 
 
 
642 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  22.18 
 
 
622 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 
947 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.31 
 
 
1183 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.22 
 
 
608 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 
1711 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 
1760 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 
1304 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.31 
 
 
1214 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1188 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.8 
 
 
1454 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  29.27 
 
 
612 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.46 
 
 
596 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.36 
 
 
1217 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  31.3 
 
 
1416 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.74 
 
 
740 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  27.43 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.46 
 
 
1856 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.97 
 
 
1523 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  24.43 
 
 
826 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.12 
 
 
1041 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.2 
 
 
1599 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  23.44 
 
 
1280 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.05 
 
 
1039 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.79 
 
 
842 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3069  predicted protein  26.43 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00421566  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02290  pre-mRNA splicing factor, putative  28.57 
 
 
615 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.55 
 
 
1686 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.62 
 
 
1367 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
576 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  27.53 
 
 
1477 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.93 
 
 
630 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.84 
 
 
1427 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.38 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25.27 
 
 
840 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.55 
 
 
737 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  23.56 
 
 
522 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  26.98 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.665929 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  30.25 
 
 
678 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  27.87 
 
 
516 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 
316 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  24.86 
 
 
215 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 
712 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.78 
 
 
1344 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 
1510 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  29.2 
 
 
1275 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 
504 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.82 
 
 
924 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  24 
 
 
320 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.52 
 
 
1209 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  28.04 
 
 
656 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.07 
 
 
1205 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.51 
 
 
1807 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.66 
 
 
1161 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.98 
 
 
1209 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.55 
 
 
919 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  28.83 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 
1411 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  23.36 
 
 
1026 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 
1481 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 
1236 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  23.72 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  28.57 
 
 
790 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.2 
 
 
1364 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.89 
 
 
1208 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.67 
 
 
742 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.56 
 
 
1242 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.97 
 
 
696 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.01 
 
 
1553 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.61 
 
 
698 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  19.19 
 
 
1868 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.36 
 
 
943 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  25 
 
 
541 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.7 
 
 
1193 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>