More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5881 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  100 
 
 
1117 aa  2315    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  50.13 
 
 
1145 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  42 
 
 
1172 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  41.87 
 
 
1172 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  29.04 
 
 
595 aa  106  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  28.13 
 
 
595 aa  102  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  27.73 
 
 
595 aa  99  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25.95 
 
 
600 aa  95.5  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  26.9 
 
 
604 aa  95.1  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  25.17 
 
 
694 aa  93.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  24.18 
 
 
588 aa  90.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  27.37 
 
 
596 aa  88.2  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  28.94 
 
 
611 aa  88.2  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  26.74 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  26.14 
 
 
604 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  26.37 
 
 
684 aa  84.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  24.58 
 
 
655 aa  83.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  26.46 
 
 
633 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  25.19 
 
 
601 aa  81.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  28.06 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  25.97 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  25.97 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  25.81 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  25.81 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  24.24 
 
 
626 aa  81.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  24.12 
 
 
677 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  24.86 
 
 
604 aa  80.5  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  27.71 
 
 
634 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  25.32 
 
 
600 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  24.12 
 
 
677 aa  79.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  24.12 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  23.95 
 
 
636 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  25.45 
 
 
571 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  25.13 
 
 
617 aa  79  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  26.73 
 
 
599 aa  78.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  25.72 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  25.64 
 
 
578 aa  77.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  23.3 
 
 
678 aa  77.4  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  24.55 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  25.45 
 
 
598 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  25.07 
 
 
544 aa  77  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  27.48 
 
 
593 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  25.64 
 
 
605 aa  76.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  25.64 
 
 
605 aa  76.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  25.56 
 
 
599 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  28.09 
 
 
583 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  25.82 
 
 
686 aa  75.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  26.21 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  25.45 
 
 
677 aa  75.1  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  27.81 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  26.99 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  26.69 
 
 
639 aa  74.7  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  27.03 
 
 
623 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  24.35 
 
 
679 aa  74.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  24.53 
 
 
584 aa  73.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  27 
 
 
590 aa  73.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  25 
 
 
647 aa  73.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  25.93 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.59 
 
 
605 aa  72.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  25.63 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  28.77 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  27.02 
 
 
642 aa  72.4  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  24.82 
 
 
682 aa  72  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  26.02 
 
 
598 aa  72  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  23.08 
 
 
616 aa  72  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  27.27 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  25.94 
 
 
607 aa  72  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  24.56 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  26.06 
 
 
626 aa  71.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  26.11 
 
 
592 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  22.93 
 
 
641 aa  70.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  28.26 
 
 
621 aa  71.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  26.96 
 
 
675 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  25.38 
 
 
573 aa  71.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  24.13 
 
 
586 aa  70.1  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  26.24 
 
 
454 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  26.21 
 
 
600 aa  69.7  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  29.33 
 
 
565 aa  69.7  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  22.55 
 
 
842 aa  69.7  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  25.69 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  28.93 
 
 
666 aa  69.3  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  26.64 
 
 
598 aa  68.9  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  25.8 
 
 
647 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  21.85 
 
 
828 aa  68.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  25.67 
 
 
587 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  25.76 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  24.43 
 
 
675 aa  68.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  23.38 
 
 
662 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  26.67 
 
 
632 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  27.02 
 
 
599 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  24.86 
 
 
614 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  24.44 
 
 
631 aa  67.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  24.88 
 
 
630 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  26.22 
 
 
646 aa  68.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  22.38 
 
 
582 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>