199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1052 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  100 
 
 		 828 aa  1726    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  35.44 
 
 		 632 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  28.92 
 
 		 769 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  27.32 
 
 		 531 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  34.52 
 
 		 486 aa  154  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  30.79 
 
 		 771 aa  152  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  27.59 
 
 		 624 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  27.92 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  25.94 
 
 		 882 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  25.08 
 
 		 759 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  23.58 
 
 		 798 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  25.91 
 
 		 755 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  24.32 
 
 		 717 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  24.13 
 
 		 760 aa  111  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  27.71 
 
 		 900 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  24.05 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  25.54 
 
 		 765 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  27.72 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  25.89 
 
 		 612 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  24.12 
 
 		 738 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.78 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.02 
 
 		 1285 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  26.38 
 
 		 842 aa  103  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  28.08 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  27.67 
 
 		 613 aa  101  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  23.66 
 
 		 725 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  27.38 
 
 		 749 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.93 
 
 		 723 aa  97.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  25.53 
 
 		 843 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  28.85 
 
 		 746 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  28.85 
 
 		 746 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.7 
 
 		 770 aa  94.7  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  26.49 
 
 		 636 aa  93.2  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  26.57 
 
 		 526 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  26.57 
 
 		 526 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 554 aa  90.5  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  25.68 
 
 		 1061 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  24.44 
 
 		 524 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.25 
 
 		 1036 aa  89  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  32.92 
 
 		 1039 aa  88.6  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.91 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  28.47 
 
 		 462 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  23.71 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  25.97 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  23.21 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  28.48 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  23.89 
 
 		 1172 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  23.89 
 
 		 1172 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  28.86 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  25.52 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  26.43 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  23.56 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  24.84 
 
 		 697 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  26.93 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  26.74 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  24.72 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.12 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  24.05 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 1145 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  24.3 
 
 		 782 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  23.39 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  23.46 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  24.86 
 
 		 598 aa  72  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  24 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  23.12 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  21.49 
 
 		 1117 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  24.44 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  24.3 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  23.62 
 
 		 874 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  23.62 
 
 		 874 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  22.95 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 548 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 775 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  24.02 
 
 		 598 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  24.92 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  25 
 
 		 601 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  24.92 
 
 		 598 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  23.2 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  22.83 
 
 		 777 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.79 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  22.29 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  22.29 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  23.59 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  22.79 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  24.85 
 
 		 600 aa  64.3  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 604 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  24.93 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  26.4 
 
 		 601 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  22.22 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  27.53 
 
 		 641 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  23.37 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  22.03 
 
 		 598 aa  60.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  25.07 
 
 		 577 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>