72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1160 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1749    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  94.07 
 
 		 843 aa  1649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  37.45 
 
 		 798 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  30.47 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  33.19 
 
 		 782 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.02 
 
 		 717 aa  231  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  34.88 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  31.6 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  31.61 
 
 		 717 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  33.41 
 
 		 738 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  31.15 
 
 		 749 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.12 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.29 
 
 		 882 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  32.49 
 
 		 760 aa  217  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  33.94 
 
 		 725 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  31.43 
 
 		 482 aa  208  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  31.09 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  36.82 
 
 		 524 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  32.47 
 
 		 857 aa  201  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  33.92 
 
 		 755 aa  201  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  34.12 
 
 		 874 aa  197  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  34.12 
 
 		 874 aa  197  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  31.4 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.51 
 
 		 470 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  30.32 
 
 		 485 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.24 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  32.6 
 
 		 467 aa  184  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  32.34 
 
 		 472 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  28.63 
 
 		 774 aa  181  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  32.57 
 
 		 697 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  28.7 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  33.83 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  27.42 
 
 		 612 aa  171  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 613 aa  171  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  29.1 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  29.1 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  30.21 
 
 		 757 aa  168  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  31.04 
 
 		 746 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  31.04 
 
 		 746 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  27.79 
 
 		 770 aa  165  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.87 
 
 		 955 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  29.1 
 
 		 788 aa  156  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  27.63 
 
 		 450 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.4 
 
 		 723 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  34 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  25.16 
 
 		 540 aa  105  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.38 
 
 		 828 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  25.07 
 
 		 769 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.9 
 
 		 606 aa  99  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  23.58 
 
 		 632 aa  90.1  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.51 
 
 		 486 aa  87.4  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  23.34 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.17 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.62 
 
 		 1285 aa  74.3  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  21.41 
 
 		 771 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0382  hypothetical protein  65.91 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.525474  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  22.55 
 
 		 1117 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  25.99 
 
 		 978 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  20.69 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.57 
 
 		 1036 aa  62  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  21.32 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  20.52 
 
 		 1000 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  30.77 
 
 		 725 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  24.56 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.36 
 
 		 542 aa  55.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  22.86 
 
 		 507 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  20.4 
 
 		 1172 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  20.4 
 
 		 1172 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  26.52 
 
 		 1145 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  22.83 
 
 		 739 aa  44.3  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>