76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5167 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  77.58 
 
 
485 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  971    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  60.59 
 
 
482 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  58.26 
 
 
462 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  54.29 
 
 
738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  52.52 
 
 
467 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  48.87 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  46.24 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  46.29 
 
 
765 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  45.25 
 
 
760 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  45.64 
 
 
759 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  41.36 
 
 
755 aa  325  9e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  54.04 
 
 
479 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  35.55 
 
 
798 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  36.84 
 
 
524 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  37.82 
 
 
526 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  37.82 
 
 
526 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  36.39 
 
 
749 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  36.58 
 
 
695 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  35.57 
 
 
782 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.1 
 
 
717 aa  227  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
717 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
717 aa  226  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.01 
 
 
874 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.01 
 
 
874 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  33.08 
 
 
843 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  36.12 
 
 
725 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  32.34 
 
 
842 aa  193  7e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  33.53 
 
 
746 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  33.53 
 
 
746 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  30.26 
 
 
554 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  30.22 
 
 
857 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  31.05 
 
 
900 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.98 
 
 
882 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.88 
 
 
697 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  30.45 
 
 
757 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  28.46 
 
 
723 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  35.86 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  25.46 
 
 
774 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.63 
 
 
770 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  34.32 
 
 
613 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  36.02 
 
 
624 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.99 
 
 
955 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.06 
 
 
788 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  32.84 
 
 
799 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  28.57 
 
 
540 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.54 
 
 
632 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  28.86 
 
 
828 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24.64 
 
 
486 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.1 
 
 
769 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.43 
 
 
531 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  22.43 
 
 
1145 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.91 
 
 
486 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.36 
 
 
1285 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  22.48 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.97 
 
 
771 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  26.18 
 
 
477 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.06 
 
 
1036 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.06 
 
 
1039 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  25.52 
 
 
605 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  23.56 
 
 
1172 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  23.56 
 
 
1172 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  21.99 
 
 
501 aa  54.7  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  22.59 
 
 
1000 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23.08 
 
 
606 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  26.34 
 
 
777 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.04 
 
 
1061 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  23.43 
 
 
902 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  29.87 
 
 
776 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  29.87 
 
 
777 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 
777 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  28.57 
 
 
777 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  28.57 
 
 
777 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  23.96 
 
 
548 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  29.22 
 
 
777 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  28.69 
 
 
978 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>