83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0490 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  100 
 
 		 882 aa  1780    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.6 
 
 		 717 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0500  hypothetical protein  63.44 
 
 		 295 aa  258  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00209207  normal  0.0267926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.2 
 
 		 717 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  32.86 
 
 		 717 aa  255  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  33.88 
 
 		 798 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  34.97 
 
 		 760 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  30.63 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  33.79 
 
 		 782 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  30.82 
 
 		 759 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.57 
 
 		 749 aa  227  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  32.71 
 
 		 755 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.51 
 
 		 843 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  32.29 
 
 		 842 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.72 
 
 		 874 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.72 
 
 		 874 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  30.46 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.99 
 
 		 900 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  27.85 
 
 		 624 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  33.8 
 
 		 725 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.25 
 
 		 746 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  35.56 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.25 
 
 		 746 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.96 
 
 		 554 aa  194  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  29.93 
 
 		 462 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  27.85 
 
 		 612 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  30.25 
 
 		 482 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  29.18 
 
 		 723 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  31.69 
 
 		 467 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  26 
 
 		 613 aa  167  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  28.23 
 
 		 695 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.17 
 
 		 857 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  31.86 
 
 		 526 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  31.86 
 
 		 526 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  29.84 
 
 		 450 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  26.73 
 
 		 955 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  26.56 
 
 		 770 aa  152  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  32.42 
 
 		 470 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.65 
 
 		 774 aa  147  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  31.19 
 
 		 697 aa  145  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  32.98 
 
 		 472 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.63 
 
 		 632 aa  138  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  32.03 
 
 		 485 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  28.8 
 
 		 769 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  29.66 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  27.3 
 
 		 757 aa  128  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  27.93 
 
 		 788 aa  127  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  29.9 
 
 		 479 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  28.66 
 
 		 486 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  25.47 
 
 		 828 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 531 aa  104  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  23.77 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  29.79 
 
 		 771 aa  99  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  23.57 
 
 		 463 aa  77  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  21.9 
 
 		 624 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.25 
 
 		 1285 aa  70.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.78 
 
 		 1061 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  23.47 
 
 		 1036 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  26.05 
 
 		 1039 aa  68.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  22.82 
 
 		 1172 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  23.06 
 
 		 1172 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.85 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.36 
 
 		 636 aa  67.4  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  26.39 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  20.93 
 
 		 1000 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  20.05 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3582  hypothetical protein  30 
 
 		 494 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000410159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  22.53 
 
 		 978 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.49 
 
 		 501 aa  50.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  25.45 
 
 		 1145 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  25.22 
 
 		 775 aa  50.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.41 
 
 		 775 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  25 
 
 		 777 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  23.54 
 
 		 777 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  24.14 
 
 		 777 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25 
 
 		 777 aa  48.5  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  23.85 
 
 		 777 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  20.45 
 
 		 902 aa  48.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3307  zinc finger, CHC2-type  38.64 
 
 		 389 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2575  ATPase-like  30.26 
 
 		 355 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.397649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  24.56 
 
 		 777 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.56 
 
 		 776 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  24.08 
 
 		 426 aa  45.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.416685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>