97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2662 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  100 
 
 		 632 aa  1311    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  35.24 
 
 		 769 aa  190  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  35.44 
 
 		 828 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  33.79 
 
 		 531 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  29.33 
 
 		 717 aa  163  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  29.33 
 
 		 717 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.87 
 
 		 900 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.05 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  30.48 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  28.95 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  29.97 
 
 		 746 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  29.97 
 
 		 746 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  28.32 
 
 		 695 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  30.09 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  29.63 
 
 		 882 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  26.59 
 
 		 771 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  27.44 
 
 		 782 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.02 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  28.9 
 
 		 749 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  28.92 
 
 		 624 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  29.05 
 
 		 798 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  27.48 
 
 		 760 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  27.43 
 
 		 697 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  27.88 
 
 		 725 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  28.32 
 
 		 755 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.73 
 
 		 759 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  28.62 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  28.62 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  24.94 
 
 		 775 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  26.54 
 
 		 1285 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  24.25 
 
 		 775 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  27.6 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  28.52 
 
 		 777 aa  106  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  24.69 
 
 		 738 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  28.15 
 
 		 777 aa  105  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  28.15 
 
 		 777 aa  105  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  25.22 
 
 		 462 aa  105  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  26.98 
 
 		 467 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  26.13 
 
 		 624 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  27.11 
 
 		 777 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  22.86 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  22.86 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.52 
 
 		 788 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  26.87 
 
 		 777 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  27.11 
 
 		 777 aa  99.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  25.07 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  29.93 
 
 		 636 aa  97.8  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  27.27 
 
 		 776 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  23.83 
 
 		 843 aa  97.4  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  24.46 
 
 		 757 aa  97.4  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  23.78 
 
 		 723 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  26.37 
 
 		 482 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  28.44 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  25.78 
 
 		 613 aa  91.3  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  24.64 
 
 		 857 aa  90.9  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  25.23 
 
 		 507 aa  90.5  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  24.66 
 
 		 612 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  23.58 
 
 		 842 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  27.16 
 
 		 485 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  25.91 
 
 		 463 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25 
 
 		 770 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  24.62 
 
 		 477 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.84 
 
 		 978 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  27.81 
 
 		 955 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  29.46 
 
 		 1061 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.32 
 
 		 774 aa  79.7  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  26.54 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  24.87 
 
 		 763 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  22.99 
 
 		 1172 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  22.99 
 
 		 1172 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  24.62 
 
 		 763 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.75 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  29.84 
 
 		 1039 aa  72  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.96 
 
 		 1000 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  24.51 
 
 		 1145 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  26.73 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  24.84 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  30.54 
 
 		 1036 aa  70.5  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  24.26 
 
 		 902 aa  67  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23.15 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  24.71 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  21.97 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  30.37 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  27.04 
 
 		 788 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  27.67 
 
 		 788 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  26.23 
 
 		 781 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0820  phage related protein  34.48 
 
 		 286 aa  51.6  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.109837  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  22.73 
 
 		 1117 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  24.87 
 
 		 548 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  26.67 
 
 		 806 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2575  ATPase-like  30.73 
 
 		 355 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.397649 
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  27.59 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  23.03 
 
 		 799 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  25.32 
 
 		 789 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  20.9 
 
 		 540 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  25.87 
 
 		 815 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  25.87 
 
 		 815 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>