85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1315 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  100 
 
 		 771 aa  1560    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  30.79 
 
 		 828 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.59 
 
 		 632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25.44 
 
 		 531 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  21.92 
 
 		 769 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  28.05 
 
 		 798 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  29.79 
 
 		 882 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.43 
 
 		 697 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.55 
 
 		 486 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  26.5 
 
 		 770 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  28.94 
 
 		 524 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  26.17 
 
 		 1172 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  24.16 
 
 		 717 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  26.17 
 
 		 1172 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  25.35 
 
 		 717 aa  87.4  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.01 
 
 		 723 aa  87  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  23.77 
 
 		 695 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  25.96 
 
 		 738 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  22.74 
 
 		 900 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  26.5 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  25.17 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.72 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  26.74 
 
 		 1145 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  22.94 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.44 
 
 		 1285 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  25.63 
 
 		 746 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  25.63 
 
 		 746 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  25.09 
 
 		 978 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  21.89 
 
 		 843 aa  74.3  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.24 
 
 		 486 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  22.77 
 
 		 774 aa  73.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  22.44 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  21.41 
 
 		 842 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  23.25 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  25.23 
 
 		 554 aa  70.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  22.05 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  22.78 
 
 		 777 aa  68.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  22.71 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  23.43 
 
 		 755 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  22.35 
 
 		 776 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  20.6 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  20.6 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  22.12 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.29 
 
 		 902 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  20.6 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  22.9 
 
 		 775 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  22.22 
 
 		 777 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  22.81 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  24.68 
 
 		 782 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  23.01 
 
 		 526 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  23.01 
 
 		 526 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  22.54 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  23.97 
 
 		 857 aa  61.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  22.33 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  24.92 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  22.15 
 
 		 765 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  22.82 
 
 		 470 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  27.27 
 
 		 920 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  23.08 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  25.55 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  25.89 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  21.96 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  23.68 
 
 		 1036 aa  57.4  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  27.27 
 
 		 450 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  21.12 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  19.72 
 
 		 463 aa  54.7  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  20.27 
 
 		 757 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.91 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  24.26 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  23.1 
 
 		 1039 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2575  ATPase-like  29.34 
 
 		 355 aa  52  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.397649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  20.7 
 
 		 477 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.1 
 
 		 1061 aa  50.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  18.83 
 
 		 763 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  18.82 
 
 		 501 aa  49.3  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  18.83 
 
 		 763 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  22.14 
 
 		 526 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  21.26 
 
 		 874 aa  47.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  21.26 
 
 		 874 aa  47.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.78 
 
 		 1000 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3311  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1082 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.331245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  25.57 
 
 		 799 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  28.76 
 
 		 820 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  23.44 
 
 		 540 aa  44.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>