51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1684 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  100 
 
 		 606 aa  1251    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.61 
 
 		 723 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.41 
 
 		 717 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  26.41 
 
 		 717 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  26.64 
 
 		 717 aa  104  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  25.1 
 
 		 843 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  25.22 
 
 		 798 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  24.9 
 
 		 842 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  26.06 
 
 		 857 aa  97.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  26.91 
 
 		 755 aa  90.9  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  25.63 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  23.08 
 
 		 900 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  25.33 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  24.67 
 
 		 749 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.38 
 
 		 697 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  26.09 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  22.47 
 
 		 738 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  27.83 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  27.83 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  28.86 
 
 		 759 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  28.5 
 
 		 765 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  24.8 
 
 		 770 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  24.85 
 
 		 882 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  26.33 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  26.33 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  26.07 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  22.25 
 
 		 695 aa  63.9  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  25.58 
 
 		 874 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  25.58 
 
 		 874 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  23.1 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  22.2 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  22.4 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  22.22 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  25 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  22.38 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  22.65 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.29 
 
 		 769 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  20.62 
 
 		 554 aa  54.3  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.91 
 
 		 771 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  23.08 
 
 		 450 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  23 
 
 		 799 aa  51.2  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.32 
 
 		 978 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  23.4 
 
 		 757 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  22.95 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  23.83 
 
 		 467 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.25 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  23.95 
 
 		 485 aa  45.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 775 aa  44.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  22.38 
 
 		 463 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  20.96 
 
 		 788 aa  43.9  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>