67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1475 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  46.92 
 
 		 757 aa  740    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  100 
 
 		 788 aa  1655    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  32.84 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  26.16 
 
 		 717 aa  180  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  26.27 
 
 		 782 aa  177  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  25.63 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  29.91 
 
 		 462 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  31.2 
 
 		 738 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.27 
 
 		 717 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  31.78 
 
 		 760 aa  171  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  29.44 
 
 		 843 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  30.13 
 
 		 874 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  30.13 
 
 		 874 aa  164  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  31.62 
 
 		 755 aa  163  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  27.14 
 
 		 900 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  30.64 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  29.31 
 
 		 482 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  29.1 
 
 		 842 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  25.44 
 
 		 695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  27.53 
 
 		 526 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  27.53 
 
 		 526 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  29.97 
 
 		 765 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  27.97 
 
 		 524 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  25.16 
 
 		 749 aa  147  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  26.75 
 
 		 723 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  28.98 
 
 		 467 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  29.29 
 
 		 725 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  26.26 
 
 		 746 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  26.26 
 
 		 746 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  28.53 
 
 		 857 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.3 
 
 		 697 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  27.93 
 
 		 882 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  26.39 
 
 		 450 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  26.06 
 
 		 472 aa  125  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  23.6 
 
 		 612 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  26.2 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  25.98 
 
 		 774 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.95 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  22.15 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  24.8 
 
 		 770 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  27.79 
 
 		 769 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  22.98 
 
 		 554 aa  111  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  22.1 
 
 		 470 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  23.52 
 
 		 955 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  25 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  25.52 
 
 		 632 aa  99.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.32 
 
 		 486 aa  94.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  24.26 
 
 		 479 aa  87.8  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  23.73 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  23.86 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.94 
 
 		 771 aa  77  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  25.38 
 
 		 624 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.05 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  22.65 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.63 
 
 		 1285 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  26.02 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  24.52 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  21.67 
 
 		 542 aa  62  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  27.91 
 
 		 1036 aa  50.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23.66 
 
 		 1061 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  27.21 
 
 		 1039 aa  50.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  26.73 
 
 		 739 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  20.31 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  20.31 
 
 		 1172 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  20.98 
 
 		 1000 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  20.25 
 
 		 1145 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>