59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2258 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  100 
 
 		 542 aa  1112    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  36.18 
 
 		 501 aa  238  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  30.96 
 
 		 739 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  25.69 
 
 		 624 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  24.66 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.21 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  26.75 
 
 		 1172 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  26.75 
 
 		 1172 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  25.61 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.43 
 
 		 1285 aa  74.7  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  21.02 
 
 		 632 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  22.53 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  22.89 
 
 		 717 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  22.89 
 
 		 717 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  22.75 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.64 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  25.76 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  23.66 
 
 		 605 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 1145 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  24.1 
 
 		 1000 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24.08 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  22.22 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  23.2 
 
 		 763 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  22.93 
 
 		 763 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  21.67 
 
 		 788 aa  62  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  25.5 
 
 		 857 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  21.1 
 
 		 900 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  19.7 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  21.36 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  17.52 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23.05 
 
 		 1061 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  20.38 
 
 		 798 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  22.85 
 
 		 757 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  20.06 
 
 		 843 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  21.46 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  19.93 
 
 		 777 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  21.12 
 
 		 771 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  20.1 
 
 		 777 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  21.33 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  20.36 
 
 		 842 aa  55.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  20.25 
 
 		 749 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  20.1 
 
 		 777 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  20.1 
 
 		 777 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  19.76 
 
 		 782 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  20.61 
 
 		 774 aa  53.5  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  19.08 
 
 		 775 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  21.6 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  19.65 
 
 		 775 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  19.63 
 
 		 776 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  18.72 
 
 		 777 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  20.09 
 
 		 1117 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  19.28 
 
 		 770 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  20.1 
 
 		 978 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  18.73 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  19.38 
 
 		 882 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  20.43 
 
 		 695 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  20.33 
 
 		 746 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  20.33 
 
 		 746 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  19.94 
 
 		 755 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>