52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0642 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  100 
 
 		 540 aa  1121    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.12 
 
 		 554 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  27.64 
 
 		 624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  26.6 
 
 		 749 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  25.99 
 
 		 900 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.28 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  26.11 
 
 		 782 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  27.07 
 
 		 955 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  28.93 
 
 		 612 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  26.78 
 
 		 843 aa  114  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  27.53 
 
 		 738 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  24.85 
 
 		 798 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  23.76 
 
 		 774 aa  110  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  25.16 
 
 		 842 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  24.5 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  26.28 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  26.43 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.56 
 
 		 723 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  23.77 
 
 		 882 aa  103  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  26.55 
 
 		 765 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  26.92 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  28.02 
 
 		 760 aa  101  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  26.99 
 
 		 462 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  28 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  28.57 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  24.62 
 
 		 857 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  23.58 
 
 		 717 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  23.78 
 
 		 770 aa  94.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  23.4 
 
 		 717 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.4 
 
 		 717 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  24.14 
 
 		 755 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  28.01 
 
 		 746 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  28.01 
 
 		 746 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  28.16 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  22.87 
 
 		 757 aa  86.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  25 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  27.2 
 
 		 874 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  27.2 
 
 		 874 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  23.58 
 
 		 725 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  27.96 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  22.65 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  23.35 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  24.89 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  24.89 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  20.98 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  22.03 
 
 		 486 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.44 
 
 		 771 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23 
 
 		 1061 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  20.9 
 
 		 769 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  20.54 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  20.9 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>