71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0842 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1080    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  37.78 
 
 
765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  36.79 
 
 
759 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  37.04 
 
 
760 aa  269  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  35.84 
 
 
738 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  35.51 
 
 
462 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  35.65 
 
 
755 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  36.38 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  36.81 
 
 
485 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  37.82 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  35.05 
 
 
470 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  31.37 
 
 
782 aa  226  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  33.78 
 
 
467 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.62 
 
 
749 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  33.33 
 
 
450 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  39.8 
 
 
479 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  31.87 
 
 
874 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  31.87 
 
 
874 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  31.8 
 
 
725 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  30.29 
 
 
717 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.15 
 
 
717 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  31.84 
 
 
717 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.62 
 
 
524 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  29.49 
 
 
798 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 
695 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  29.1 
 
 
842 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  29.47 
 
 
843 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.69 
 
 
900 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  31.86 
 
 
882 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  30.62 
 
 
746 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  30.62 
 
 
746 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  27.53 
 
 
788 aa  153  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  30.11 
 
 
697 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.12 
 
 
774 aa  140  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  27.48 
 
 
757 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  32.03 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  27.79 
 
 
857 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  24.24 
 
 
770 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  30.8 
 
 
613 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  27.25 
 
 
624 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  23.46 
 
 
723 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.92 
 
 
799 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  29.69 
 
 
955 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  22.86 
 
 
632 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  29.49 
 
 
612 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.79 
 
 
486 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.57 
 
 
828 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25.08 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  21.52 
 
 
769 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.64 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  27.83 
 
 
606 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.43 
 
 
978 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  19.51 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  20.83 
 
 
1145 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  24.89 
 
 
540 aa  63.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.01 
 
 
771 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  18.86 
 
 
1172 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  30.41 
 
 
624 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  18.97 
 
 
1172 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.36 
 
 
1061 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  21.48 
 
 
775 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  23.43 
 
 
1039 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  21.6 
 
 
501 aa  46.6  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  22.78 
 
 
1036 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  21.22 
 
 
777 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  21.22 
 
 
777 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  21.22 
 
 
777 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  24.71 
 
 
777 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  21.79 
 
 
507 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  18.8 
 
 
1000 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>