81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8782 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  995    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  67.6 
 
 		 462 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  60.14 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  58.62 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  59.68 
 
 		 738 aa  519  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  52.17 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  50.55 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  46.42 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  46.21 
 
 		 760 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  46.31 
 
 		 765 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  47.03 
 
 		 759 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  45.39 
 
 		 755 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  58.54 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  35.63 
 
 		 798 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  35.24 
 
 		 717 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  35.24 
 
 		 717 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  35.02 
 
 		 717 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  36.38 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  36.38 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  34.76 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  33.72 
 
 		 749 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.82 
 
 		 782 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  36.08 
 
 		 874 aa  243  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  36.08 
 
 		 874 aa  243  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  33.78 
 
 		 695 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  35.87 
 
 		 725 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.45 
 
 		 746 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.45 
 
 		 746 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  31.42 
 
 		 842 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.06 
 
 		 843 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  31.12 
 
 		 857 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  29.96 
 
 		 900 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  30.11 
 
 		 882 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.1 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  36.47 
 
 		 612 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.87 
 
 		 697 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  34.57 
 
 		 955 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  28.44 
 
 		 723 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  35.15 
 
 		 613 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  31.21 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  29.31 
 
 		 788 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  30.06 
 
 		 757 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.59 
 
 		 770 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.4 
 
 		 774 aa  143  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  34.7 
 
 		 799 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  23.5 
 
 		 769 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.69 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.37 
 
 		 632 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.75 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  25.97 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  21.58 
 
 		 1000 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.56 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.52 
 
 		 531 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  22.49 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  19.82 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  19.82 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.24 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.55 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  21.95 
 
 		 1145 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.44 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.73 
 
 		 1285 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  26.04 
 
 		 548 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  25.21 
 
 		 777 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  29.03 
 
 		 777 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  29.03 
 
 		 776 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  25.75 
 
 		 777 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  29.03 
 
 		 777 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  29.03 
 
 		 777 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  25.19 
 
 		 1039 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  20.76 
 
 		 902 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  29.03 
 
 		 777 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  26.8 
 
 		 978 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25 
 
 		 1036 aa  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  25.42 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  24.11 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  29.94 
 
 		 775 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  25.71 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  29.3 
 
 		 775 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  22.97 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  22.22 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  24.33 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>