86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1000 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  100 
 
 		 723 aa  1506    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.5 
 
 		 717 aa  280  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.93 
 
 		 717 aa  277  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.07 
 
 		 717 aa  273  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  32.16 
 
 		 798 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  26.99 
 
 		 749 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  27.79 
 
 		 782 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  29.11 
 
 		 760 aa  196  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  29.27 
 
 		 770 aa  195  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  28.77 
 
 		 759 aa  194  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  28.34 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  28.34 
 
 		 765 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  27.09 
 
 		 900 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  29.18 
 
 		 882 aa  181  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.2 
 
 		 774 aa  179  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  27.52 
 
 		 695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  27.42 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  27.39 
 
 		 612 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  30.21 
 
 		 524 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  28.38 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  26.02 
 
 		 874 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  26.02 
 
 		 874 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  24.89 
 
 		 746 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  24.89 
 
 		 746 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  28.44 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  25.38 
 
 		 843 aa  163  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  27.12 
 
 		 857 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  25.34 
 
 		 725 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  26.74 
 
 		 738 aa  157  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  27.1 
 
 		 955 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  27.51 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  24.4 
 
 		 842 aa  152  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  30.26 
 
 		 467 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.75 
 
 		 788 aa  147  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  24.82 
 
 		 697 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  28.27 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  24.69 
 
 		 613 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  25.58 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  28.46 
 
 		 472 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  23.29 
 
 		 757 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  28.13 
 
 		 450 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  29.26 
 
 		 479 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.61 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  23.46 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  23.46 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  24.56 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  25.17 
 
 		 769 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.69 
 
 		 486 aa  97.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.93 
 
 		 828 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  23.78 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  24.92 
 
 		 531 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.01 
 
 		 771 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2842  hypothetical protein  34.46 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326293  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.81 
 
 		 486 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  23.35 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  27.93 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  25.31 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.69 
 
 		 1285 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 667 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.84 
 
 		 1036 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  24.51 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  24.6 
 
 		 1145 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  18.73 
 
 		 978 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.59 
 
 		 1172 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.59 
 
 		 1172 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  21.15 
 
 		 501 aa  51.2  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  41.67 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.31 
 
 		 271 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  21.02 
 
 		 507 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  27.15 
 
 		 263 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  20.44 
 
 		 777 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  21.14 
 
 		 775 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  47.06 
 
 		 183 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  43.14 
 
 		 102 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  20.23 
 
 		 777 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  43.14 
 
 		 266 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  43.14 
 
 		 266 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  21.38 
 
 		 777 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  20.34 
 
 		 776 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  21.38 
 
 		 777 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  21.38 
 
 		 777 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  28.97 
 
 		 1117 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  17.65 
 
 		 605 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  21.84 
 
 		 548 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>