37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3733 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
271 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  40.91 
 
 
391 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  38.33 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.2 
 
 
749 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.67 
 
 
955 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.22 
 
 
717 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.18 
 
 
970 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.19 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.46 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.41 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.88 
 
 
970 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  32.07 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.72 
 
 
717 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  29.95 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  37.56 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.11 
 
 
746 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  31.52 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  29.95 
 
 
717 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  30.48 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  40 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.5 
 
 
746 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  31.76 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.5 
 
 
746 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.14 
 
 
599 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.78 
 
 
1006 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  36.44 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.76 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.81 
 
 
1002 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.98 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.76 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.31 
 
 
723 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2259  hypothetical protein  27.57 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  30.43 
 
 
667 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.18 
 
 
206 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  29.61 
 
 
689 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  29.61 
 
 
724 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27533  predicted protein  30.26 
 
 
423 aa  42  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.413255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>