50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0946 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  76.12 
 
 		 477 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  100 
 
 		 605 aa  1258    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  52.7 
 
 		 775 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  53.18 
 
 		 775 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  50.21 
 
 		 776 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  50.21 
 
 		 777 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  50 
 
 		 777 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  49.58 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  50.88 
 
 		 777 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  50.88 
 
 		 777 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  51.47 
 
 		 763 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  50.66 
 
 		 777 aa  475  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  51.24 
 
 		 763 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  27.33 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  75.36 
 
 		 711 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  71.54 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  51.68 
 
 		 713 aa  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  29.66 
 
 		 1172 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  29.66 
 
 		 1172 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  26.94 
 
 		 1145 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  25.44 
 
 		 1000 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  25.45 
 
 		 1285 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  41.73 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  25.45 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.92 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.71 
 
 		 771 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  23.66 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  25 
 
 		 467 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.35 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  25.32 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  25.63 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24.78 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  20.87 
 
 		 769 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  25.96 
 
 		 624 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  25.51 
 
 		 782 aa  54.3  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  23.39 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  26.27 
 
 		 507 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  24.37 
 
 		 749 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  23.94 
 
 		 482 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  21.92 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  24.33 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  20.55 
 
 		 697 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  23.2 
 
 		 857 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  22.81 
 
 		 717 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  17.65 
 
 		 723 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  23.51 
 
 		 725 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  23.42 
 
 		 485 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  20.71 
 
 		 501 aa  44.3  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  23.79 
 
 		 738 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  22.37 
 
 		 717 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>