61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1079 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  84.99 
 
 
1039 aa  1838    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  100 
 
 
1036 aa  2151    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  47.61 
 
 
1061 aa  884    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  32.92 
 
 
828 aa  89  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  28.28 
 
 
463 aa  88.6  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  29.17 
 
 
507 aa  87.8  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  28.04 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  31.61 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  27.59 
 
 
1172 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  27.59 
 
 
1172 aa  72.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  30.54 
 
 
632 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  23.47 
 
 
882 aa  69.7  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  26.56 
 
 
717 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  29.56 
 
 
531 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  26.06 
 
 
717 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  27.65 
 
 
1145 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  23.55 
 
 
770 aa  66.6  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  28.39 
 
 
1285 aa  65.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  25.73 
 
 
717 aa  65.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  24.65 
 
 
501 aa  65.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  30.06 
 
 
843 aa  65.1  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  28.43 
 
 
624 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.05 
 
 
900 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  23.81 
 
 
695 aa  62.4  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  22.96 
 
 
746 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  22.96 
 
 
746 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  28.57 
 
 
842 aa  62  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  25.26 
 
 
866 aa  60.1  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.9 
 
 
470 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  25.31 
 
 
612 aa  59.3  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  27.24 
 
 
738 aa  58.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  25.84 
 
 
723 aa  58.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.12 
 
 
554 aa  58.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.68 
 
 
771 aa  57.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  25.34 
 
 
739 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  25.33 
 
 
782 aa  55.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  25.21 
 
 
486 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  23.9 
 
 
613 aa  54.3  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  25.32 
 
 
697 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  28.57 
 
 
760 aa  53.5  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  22.66 
 
 
769 aa  53.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.13 
 
 
757 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  24.71 
 
 
755 aa  53.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  25.15 
 
 
820 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  28.57 
 
 
765 aa  52.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  28.66 
 
 
798 aa  51.6  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  29.63 
 
 
749 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.27 
 
 
759 aa  51.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  27.91 
 
 
788 aa  51.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  25.16 
 
 
548 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  25 
 
 
482 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  24.84 
 
 
462 aa  48.9  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  27.89 
 
 
524 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.22 
 
 
774 aa  47.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  22.78 
 
 
526 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  22.78 
 
 
526 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  28.06 
 
 
472 aa  46.2  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  22.04 
 
 
1000 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3471  replication protein  27.03 
 
 
448 aa  45.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.819035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  25.82 
 
 
857 aa  44.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  27.5 
 
 
467 aa  44.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>