66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0072 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  100 
 
 		 757 aa  1589    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  46.92 
 
 		 788 aa  740    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  28.76 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  28.67 
 
 		 717 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  28.35 
 
 		 717 aa  194  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  33.25 
 
 		 798 aa  194  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  30.99 
 
 		 843 aa  177  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.95 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  30.21 
 
 		 842 aa  168  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  26.38 
 
 		 782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  29.4 
 
 		 874 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  29.4 
 
 		 874 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.81 
 
 		 524 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  29.94 
 
 		 462 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  26.5 
 
 		 695 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  26.33 
 
 		 900 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  31.5 
 
 		 759 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  30.06 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  30.56 
 
 		 765 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.92 
 
 		 760 aa  154  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  29.65 
 
 		 725 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  28.82 
 
 		 755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  29.4 
 
 		 749 aa  140  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  27.48 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  27.48 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  30.48 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  29.28 
 
 		 467 aa  137  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  25.35 
 
 		 746 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  25.35 
 
 		 746 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  26.18 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  25.37 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  23.29 
 
 		 723 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  27.3 
 
 		 882 aa  128  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  29.39 
 
 		 485 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  25.11 
 
 		 857 aa  124  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  26.41 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  24.42 
 
 		 624 aa  117  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  23.67 
 
 		 470 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  25.42 
 
 		 955 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.42 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  27.78 
 
 		 450 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  22.72 
 
 		 770 aa  104  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  25.58 
 
 		 697 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  28.37 
 
 		 479 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.77 
 
 		 632 aa  97.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  25.38 
 
 		 769 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  28.42 
 
 		 463 aa  87.8  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  27.94 
 
 		 624 aa  87.4  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  24.04 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  22.62 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  26.75 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  25.17 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.46 
 
 		 799 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.06 
 
 		 1285 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  27.59 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  22.85 
 
 		 542 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  20.27 
 
 		 771 aa  54.3  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  24.19 
 
 		 739 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  28.37 
 
 		 1000 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  29.13 
 
 		 1036 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.56 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  23.39 
 
 		 507 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  28.47 
 
 		 1039 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23.4 
 
 		 606 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  20.81 
 
 		 477 aa  43.9  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>