91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2797 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 
782 aa  1615    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  37.42 
 
 
717 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  38.06 
 
 
717 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  38.55 
 
 
717 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  37.78 
 
 
798 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  39.55 
 
 
746 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  39.55 
 
 
746 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  34.53 
 
 
695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  37.91 
 
 
749 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  37.36 
 
 
524 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  38.21 
 
 
760 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  38.3 
 
 
759 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  32.64 
 
 
900 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  37.1 
 
 
765 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.99 
 
 
738 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  35.65 
 
 
755 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  33.48 
 
 
462 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  34.26 
 
 
843 aa  250  9e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  33.79 
 
 
857 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  32.89 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  33.19 
 
 
842 aa  241  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  33.79 
 
 
882 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.48 
 
 
554 aa  231  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  35.04 
 
 
697 aa  228  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  34.26 
 
 
485 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  31.37 
 
 
526 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  31.37 
 
 
526 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  33.81 
 
 
467 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  35.57 
 
 
472 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  30.84 
 
 
770 aa  213  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  33.26 
 
 
470 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.79 
 
 
723 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.6 
 
 
774 aa  207  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  32.2 
 
 
874 aa  207  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  32.2 
 
 
874 aa  207  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  32.83 
 
 
725 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  33.11 
 
 
450 aa  201  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  29.71 
 
 
612 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  31.62 
 
 
624 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.9 
 
 
955 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  37.5 
 
 
479 aa  178  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.27 
 
 
788 aa  177  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  27.98 
 
 
613 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  26.38 
 
 
757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.44 
 
 
632 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.11 
 
 
540 aa  123  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.76 
 
 
769 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.42 
 
 
486 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.34 
 
 
799 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.66 
 
 
531 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 
486 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  25.63 
 
 
606 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  23.5 
 
 
1172 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  23.5 
 
 
1172 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.06 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.3 
 
 
828 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  25 
 
 
1061 aa  71.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  24.54 
 
 
1145 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  24.07 
 
 
777 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  25.2 
 
 
477 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.5 
 
 
636 aa  64.7  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  30.4 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  28.12 
 
 
788 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  22.8 
 
 
978 aa  62  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.68 
 
 
771 aa  62  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  21.18 
 
 
1000 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  27.56 
 
 
788 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  26.1 
 
 
777 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  26.1 
 
 
777 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  26.1 
 
 
777 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.73 
 
 
1285 aa  58.9  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  25.78 
 
 
717 aa  58.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  31.45 
 
 
789 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  26.1 
 
 
777 aa  57.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  30.94 
 
 
818 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  25.91 
 
 
775 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  25.7 
 
 
777 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  22.44 
 
 
624 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.33 
 
 
1036 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.91 
 
 
775 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  26.22 
 
 
1039 aa  54.3  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  25.51 
 
 
605 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  26.1 
 
 
776 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  19.76 
 
 
542 aa  53.9  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  28.57 
 
 
806 aa  50.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  27.78 
 
 
789 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  31.31 
 
 
815 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  31.31 
 
 
815 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  20.63 
 
 
739 aa  48.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  20.98 
 
 
507 aa  48.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  20.63 
 
 
501 aa  44.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>