84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1367 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 524 aa  1080    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  49.56 
 
 		 695 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  38.81 
 
 		 760 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  37.36 
 
 		 782 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  36.38 
 
 		 717 aa  300  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  39.04 
 
 		 759 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  36.38 
 
 		 798 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  36.43 
 
 		 717 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  37.89 
 
 		 755 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  36.16 
 
 		 717 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  37.34 
 
 		 765 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  36.55 
 
 		 749 aa  269  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  33.82 
 
 		 746 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  33.82 
 
 		 746 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  35.44 
 
 		 462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  33.4 
 
 		 900 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  34.12 
 
 		 738 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  38.97 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  34.72 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  35.01 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  36.84 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  33.63 
 
 		 485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  34.36 
 
 		 857 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  32.17 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.79 
 
 		 725 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  35.88 
 
 		 612 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  30.68 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  37.13 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  30.94 
 
 		 874 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  30.94 
 
 		 874 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  36.82 
 
 		 842 aa  203  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  34.98 
 
 		 843 aa  200  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  41.35 
 
 		 613 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  35.56 
 
 		 882 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.68 
 
 		 955 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  34.46 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  26.62 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  26.62 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  33.66 
 
 		 479 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  30.21 
 
 		 723 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.9 
 
 		 774 aa  160  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  26.81 
 
 		 757 aa  160  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  26.68 
 
 		 770 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  27.97 
 
 		 788 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  30.09 
 
 		 632 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.28 
 
 		 540 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.59 
 
 		 769 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  28.3 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  28.16 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.45 
 
 		 799 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  28.94 
 
 		 771 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.44 
 
 		 828 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  28.37 
 
 		 777 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  28.37 
 
 		 777 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  25.33 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  28.08 
 
 		 777 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  26.05 
 
 		 1172 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  25.6 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  26.05 
 
 		 1172 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  26.79 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  31.38 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  26.42 
 
 		 1145 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  28.01 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  26.51 
 
 		 776 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  22.03 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  27.23 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  26.81 
 
 		 775 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.2 
 
 		 1285 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.24 
 
 		 978 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  25.32 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  25.32 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  24.51 
 
 		 507 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  21.38 
 
 		 501 aa  53.9  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  19.15 
 
 		 1000 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  23.68 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.71 
 
 		 902 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  25.51 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  25.51 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.86 
 
 		 636 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  27.89 
 
 		 1036 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  27.89 
 
 		 1039 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  20.58 
 
 		 624 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  40.74 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  21.88 
 
 		 548 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>