101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3115 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 695 aa  1428    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  49.56 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  34.53 
 
 		 782 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  37.5 
 
 		 798 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  37.02 
 
 		 749 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  37.05 
 
 		 717 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  36.82 
 
 		 717 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  36.36 
 
 		 717 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  38.65 
 
 		 765 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  39.7 
 
 		 759 aa  277  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  37.23 
 
 		 760 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  38.32 
 
 		 755 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.96 
 
 		 746 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.96 
 
 		 746 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  34.42 
 
 		 738 aa  257  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  34.41 
 
 		 462 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  30.47 
 
 		 842 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  33.47 
 
 		 843 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  33.77 
 
 		 900 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  33.78 
 
 		 482 aa  241  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.12 
 
 		 554 aa  231  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  36.58 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  34.18 
 
 		 857 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  32.28 
 
 		 450 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  33.18 
 
 		 467 aa  218  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  35.14 
 
 		 485 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  35.28 
 
 		 697 aa  204  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.04 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.42 
 
 		 955 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  32.26 
 
 		 624 aa  197  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  32.99 
 
 		 725 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  31.07 
 
 		 874 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  31.07 
 
 		 874 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  26.82 
 
 		 612 aa  188  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.52 
 
 		 723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  27.27 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  27.27 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  29.47 
 
 		 770 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.22 
 
 		 774 aa  171  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  27.83 
 
 		 613 aa  170  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  34.46 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  28.23 
 
 		 882 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  26.5 
 
 		 757 aa  158  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.44 
 
 		 788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  28.32 
 
 		 632 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.83 
 
 		 799 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  28.08 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  29.31 
 
 		 486 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.72 
 
 		 828 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.43 
 
 		 540 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  27.54 
 
 		 486 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  42.06 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  23.88 
 
 		 771 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.51 
 
 		 463 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  25.69 
 
 		 1000 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  21.98 
 
 		 1285 aa  74.3  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  24.22 
 
 		 1145 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.71 
 
 		 1172 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.5 
 
 		 1172 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  23.64 
 
 		 477 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 734 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  26.1 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  26.1 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  25.16 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.13 
 
 		 636 aa  63.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  22.25 
 
 		 606 aa  63.9  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  21.54 
 
 		 624 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  26.16 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25.38 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  23.81 
 
 		 1036 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  26.37 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  42.71 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.82 
 
 		 1061 aa  61.2  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  25.87 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.11 
 
 		 958 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.11 
 
 		 958 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.8 
 
 		 953 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  25.63 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.8 
 
 		 953 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.93 
 
 		 776 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  30 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  22.37 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  24.86 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  36.9 
 
 		 1287 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  23 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  41.49 
 
 		 741 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  35.37 
 
 		 736 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  36.25 
 
 		 955 aa  53.9  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  24.58 
 
 		 763 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  24.58 
 
 		 763 aa  53.5  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35 
 
 		 955 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  35 
 
 		 950 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  35 
 
 		 950 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  23.95 
 
 		 775 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  23.21 
 
 		 775 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.43 
 
 		 542 aa  48.5  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  21.11 
 
 		 507 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  20.28 
 
 		 739 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  35.71 
 
 		 765 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>