56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4941 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  100 
 
 		 736 aa  1519    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  37.85 
 
 		 815 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  37.85 
 
 		 815 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  41.23 
 
 		 818 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  33.54 
 
 		 788 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  41.77 
 
 		 781 aa  161  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  33.54 
 
 		 788 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  39.47 
 
 		 789 aa  160  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  28.74 
 
 		 695 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  34.23 
 
 		 789 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  30.86 
 
 		 744 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  32.79 
 
 		 739 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  32.08 
 
 		 896 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  31.52 
 
 		 835 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  38.1 
 
 		 509 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  33.85 
 
 		 413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  27.81 
 
 		 736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  29.82 
 
 		 806 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  30.83 
 
 		 892 aa  108  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  27.06 
 
 		 489 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  34.55 
 
 		 717 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  26.52 
 
 		 761 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  26.55 
 
 		 812 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  31.09 
 
 		 697 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  31.5 
 
 		 662 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  28.92 
 
 		 400 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  28.71 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  23.66 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  26.3 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  23.7 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  39.78 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  21.84 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  34.94 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  33.73 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  21.38 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  37.8 
 
 		 955 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  37.97 
 
 		 950 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  34.94 
 
 		 955 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.66 
 
 		 953 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.97 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  35.44 
 
 		 615 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.18 
 
 		 953 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  37.04 
 
 		 958 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  35.44 
 
 		 615 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  37.04 
 
 		 958 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  32.43 
 
 		 621 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  35.37 
 
 		 695 aa  54.7  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  30.51 
 
 		 218 aa  54.7  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  30.21 
 
 		 637 aa  54.3  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  28.3 
 
 		 644 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  31.5 
 
 		 751 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  41.18 
 
 		 734 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  34.18 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  36.59 
 
 		 765 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  32.39 
 
 		 797 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  35.71 
 
 		 1287 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>