37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2155 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  100 
 
 		 695 aa  1436    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  54.39 
 
 		 413 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  54.23 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  43.17 
 
 		 744 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  39.69 
 
 		 736 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  36.5 
 
 		 739 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  41.14 
 
 		 835 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  39.32 
 
 		 896 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  38.39 
 
 		 815 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  38.39 
 
 		 815 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  42.58 
 
 		 818 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  41.82 
 
 		 789 aa  187  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  32.22 
 
 		 489 aa  187  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  37.54 
 
 		 892 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  35.88 
 
 		 781 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  37.55 
 
 		 788 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  37.55 
 
 		 788 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  30.49 
 
 		 806 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  29.29 
 
 		 761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  37.6 
 
 		 789 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  28.74 
 
 		 736 aa  157  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  30.19 
 
 		 812 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  30.82 
 
 		 697 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  26.33 
 
 		 725 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  30.93 
 
 		 662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  34.16 
 
 		 476 aa  110  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  30.95 
 
 		 431 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  31.88 
 
 		 778 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  32.47 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  42.68 
 
 		 666 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  29.89 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  29.89 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  34.45 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  28.1 
 
 		 746 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  28.1 
 
 		 746 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.32 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.92 
 
 		 1006 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>