46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1624 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1624  primase 2  100 
 
 		 309 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35.25 
 
 		 955 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  35.25 
 
 		 950 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  32.48 
 
 		 950 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  34.89 
 
 		 955 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.12 
 
 		 958 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.12 
 
 		 958 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35 
 
 		 953 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  30.79 
 
 		 797 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  33.93 
 
 		 953 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  30.4 
 
 		 637 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  29.57 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  27.65 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  27.37 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  27.37 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  29.1 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  27.99 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  29.25 
 
 		 818 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  26.46 
 
 		 775 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  40.79 
 
 		 1287 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  27.31 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  43.06 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  27.6 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  28.64 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  40.48 
 
 		 751 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  30 
 
 		 695 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  30.81 
 
 		 776 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  33.73 
 
 		 736 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  27.68 
 
 		 890 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  27.75 
 
 		 777 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  27.23 
 
 		 890 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  33.11 
 
 		 835 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  27.87 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  35.94 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  23.44 
 
 		 765 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25.71 
 
 		 777 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  31.84 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  27.42 
 
 		 777 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  27.42 
 
 		 777 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  27.42 
 
 		 777 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  36.21 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  36.9 
 
 		 741 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  27.03 
 
 		 848 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.23 
 
 		 681 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.07 
 
 		 678 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.07 
 
 		 681 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>