21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0063 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  35.28 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  31.6 
 
 		 1287 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  40.32 
 
 		 797 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  42.47 
 
 		 741 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  39.02 
 
 		 958 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  39.02 
 
 		 958 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.8 
 
 		 953 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  38.89 
 
 		 751 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.8 
 
 		 953 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  35.94 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  43.55 
 
 		 955 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  43.55 
 
 		 950 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  38.1 
 
 		 615 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  38.1 
 
 		 615 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  43.55 
 
 		 950 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  41.54 
 
 		 955 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  36.51 
 
 		 615 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.72 
 
 		 599 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  35 
 
 		 620 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  38.89 
 
 		 736 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>