36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5495 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  39.12 
 
 		 1287 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  35.28 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  33.91 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  35.83 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  35.83 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  35.83 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  37.18 
 
 		 741 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  35 
 
 		 717 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.36 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.36 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  40 
 
 		 183 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.17 
 
 		 717 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  32.5 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  31.34 
 
 		 797 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  32.5 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  36.14 
 
 		 695 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  34.33 
 
 		 950 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  34.33 
 
 		 955 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.33 
 
 		 950 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  36.21 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  32.5 
 
 		 953 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  32.5 
 
 		 953 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.58 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.77 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  32.5 
 
 		 958 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  32.5 
 
 		 958 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  30.88 
 
 		 621 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  26.81 
 
 		 765 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.13 
 
 		 599 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  30 
 
 		 620 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  28.21 
 
 		 621 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  34.92 
 
 		 955 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.52 
 
 		 746 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  29.49 
 
 		 615 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  29.49 
 
 		 615 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>