56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2001 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  92.93 
 
 
283 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  53.28 
 
 
287 aa  292  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  48.42 
 
 
289 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  42.35 
 
 
717 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  42.35 
 
 
717 aa  198  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  42.34 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  40.21 
 
 
717 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  43.19 
 
 
266 aa  188  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  38.93 
 
 
746 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  41.63 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  41.96 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  41.96 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.24 
 
 
599 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  41.71 
 
 
183 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  39.91 
 
 
746 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  39.91 
 
 
746 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  42.95 
 
 
749 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  28.74 
 
 
255 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  34.06 
 
 
667 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  33.83 
 
 
955 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  44.03 
 
 
206 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.37 
 
 
201 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.37 
 
 
201 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  37.14 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.72 
 
 
970 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.72 
 
 
970 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.19 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.95 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.96 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  38.21 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  30.96 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  36.81 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  30.3 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2259  hypothetical protein  25.11 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  38.46 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.73 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.77 
 
 
223 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.98 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  35.58 
 
 
692 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.65 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.94 
 
 
1002 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  32.16 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.12 
 
 
1006 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  39.53 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  31.08 
 
 
158 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  36.36 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  29.41 
 
 
756 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.19 
 
 
400 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  37.35 
 
 
102 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  29.29 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  34.65 
 
 
402 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.17 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  41.27 
 
 
94 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>