50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0745 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
287 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  52.55 
 
 
283 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  53.28 
 
 
283 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  41.24 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  40.37 
 
 
717 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  41.03 
 
 
717 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  40.66 
 
 
717 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  40.84 
 
 
266 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.53 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  39.69 
 
 
266 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  39.85 
 
 
263 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  39.08 
 
 
263 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  36.6 
 
 
746 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.15 
 
 
599 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  38.42 
 
 
183 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  35.4 
 
 
746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  35.4 
 
 
746 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  41.67 
 
 
749 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.58 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.7 
 
 
955 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.58 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32 
 
 
970 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  29.51 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32 
 
 
970 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  31.76 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  29.59 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.41 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  28.7 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.29 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.14 
 
 
1002 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.72 
 
 
667 aa  65.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  34.13 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.31 
 
 
1006 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  34.59 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  39.52 
 
 
692 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  29.24 
 
 
391 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.16 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.92 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  34.15 
 
 
158 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  25.28 
 
 
214 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  28.87 
 
 
402 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.85 
 
 
236 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.48 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.76 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  37.31 
 
 
220 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  32.58 
 
 
305 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.1 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  31.88 
 
 
756 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.42 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>