131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2847 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  94.28 
 
 		 717 aa  1421    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 717 aa  1489    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  95.12 
 
 		 717 aa  1436    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  90.87 
 
 		 263 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  88.24 
 
 		 266 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  90.48 
 
 		 263 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  85.49 
 
 		 266 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  47.73 
 
 		 798 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.85 
 
 		 749 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  36.43 
 
 		 746 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  36.43 
 
 		 746 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  37.42 
 
 		 782 aa  332  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  41.08 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  38.44 
 
 		 765 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  38.19 
 
 		 755 aa  306  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  39.68 
 
 		 759 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  84.88 
 
 		 183 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  36.38 
 
 		 524 aa  300  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  37.27 
 
 		 738 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  36.36 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  30.5 
 
 		 723 aa  280  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  32.48 
 
 		 900 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 		 874 aa  261  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 		 874 aa  261  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  35.88 
 
 		 482 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.86 
 
 		 882 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  33.26 
 
 		 857 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  35.23 
 
 		 462 aa  248  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  34.53 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  28.53 
 
 		 697 aa  241  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  32.06 
 
 		 770 aa  239  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.28 
 
 		 843 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.77 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  31.61 
 
 		 842 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  33.63 
 
 		 467 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.08 
 
 		 955 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.5 
 
 		 774 aa  219  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.11 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  32.79 
 
 		 485 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  33.18 
 
 		 472 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  33.93 
 
 		 624 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  31.09 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.35 
 
 		 283 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  28.81 
 
 		 613 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  28.35 
 
 		 757 aa  194  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  33.16 
 
 		 612 aa  191  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.57 
 
 		 283 aa  190  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  30.15 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  30.15 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  40.07 
 
 		 746 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.66 
 
 		 287 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.16 
 
 		 788 aa  180  8e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  34.02 
 
 		 479 aa  168  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  38.63 
 
 		 289 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  38.52 
 
 		 289 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.33 
 
 		 632 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  81.32 
 
 		 102 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.33 
 
 		 599 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  27.01 
 
 		 769 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  84.72 
 
 		 94 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  26.67 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.56 
 
 		 667 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  30.07 
 
 		 799 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  26.09 
 
 		 531 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  24.05 
 
 		 828 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  30.36 
 
 		 255 aa  105  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  26.41 
 
 		 606 aa  104  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  24.43 
 
 		 1285 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  24.86 
 
 		 1172 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  24.86 
 
 		 1172 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.46 
 
 		 206 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  23.4 
 
 		 540 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  22.61 
 
 		 978 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.35 
 
 		 771 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  30.2 
 
 		 486 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.18 
 
 		 970 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  25.53 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.29 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  30.56 
 
 		 1061 aa  80.1  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  34.05 
 
 		 290 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.63 
 
 		 1145 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.71 
 
 		 970 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.48 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.25 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  24.66 
 
 		 636 aa  77  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  20.98 
 
 		 624 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.85 
 
 		 201 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  26.74 
 
 		 777 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  27.64 
 
 		 775 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  26.02 
 
 		 777 aa  72  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  24.26 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  22.89 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  25.84 
 
 		 777 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  25.84 
 
 		 777 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  25.84 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  30.65 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.95 
 
 		 271 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  26.06 
 
 		 1036 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  28.64 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  27.03 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>