56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1177 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  92.93 
 
 		 283 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  52.55 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  46.32 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  41.64 
 
 		 717 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  41.61 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  40.57 
 
 		 717 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  41.44 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  38.64 
 
 		 746 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  38.43 
 
 		 717 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  39.92 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  40.78 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  40.23 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.13 
 
 		 599 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  39.66 
 
 		 746 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  39.66 
 
 		 746 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  40.57 
 
 		 183 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  40.23 
 
 		 749 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  37.79 
 
 		 955 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  28.74 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  35.22 
 
 		 667 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.88 
 
 		 201 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.88 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.4 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.34 
 
 		 970 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.34 
 
 		 970 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  36 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  31.47 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.46 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.55 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.36 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  37.4 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.81 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.16 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  33.17 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  30.96 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2259  hypothetical protein  26.58 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  35.07 
 
 		 692 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.98 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  29 
 
 		 1006 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.57 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  31.56 
 
 		 391 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  30.18 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  36.36 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  36.45 
 
 		 158 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 756 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.11 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  36 
 
 		 402 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  27.86 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.77 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0820  phage related protein  41.43 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.109837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>