14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3600 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
226 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  90.99 
 
 
223 aa  380  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.42 
 
 
223 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.24 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  36.61 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.29 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  33.33 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.73 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  32.57 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.85 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.07 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.86 
 
 
283 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.72 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>