43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0829 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  46.52 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  46.99 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  37.5 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  37.5 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  32.42 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.61 
 
 		 970 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.31 
 
 		 667 aa  79.7  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.51 
 
 		 970 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.29 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  33.91 
 
 		 955 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  28.83 
 
 		 749 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.52 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  36.25 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  32.91 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  32.48 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  33.77 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.12 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.5 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  33.12 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  33.12 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.8 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.33 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  33.82 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.33 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  37.88 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.19 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.1 
 
 		 1006 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  26.85 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.59 
 
 		 206 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.89 
 
 		 201 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.87 
 
 		 599 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.88 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  31.52 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  30.12 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  32.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.04 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.56 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  26.19 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.36 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>