29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8778 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  36.27 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.25 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  35.47 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.55 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  36.76 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  36.31 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  34.64 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.16 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.77 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.67 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.16 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  30.17 
 
 		 717 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  30.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  27.27 
 
 		 717 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  29.15 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.19 
 
 		 717 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.53 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  26.11 
 
 		 746 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  25.88 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  27.32 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.56 
 
 		 599 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  26.67 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8372  hypothetical protein  42.65 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  29.74 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  28.68 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8002  hypothetical protein  30.13 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>