30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2729 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  67.32 
 
 
217 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  58.99 
 
 
213 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  61.31 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  60.61 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.22 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.27 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  37.79 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  36.84 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.77 
 
 
717 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.9 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.65 
 
 
717 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.68 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  27.72 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.53 
 
 
717 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.34 
 
 
599 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  29.53 
 
 
263 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  25.27 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  28.49 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  29.7 
 
 
746 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.64 
 
 
955 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.34 
 
 
400 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.62 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  32.26 
 
 
94 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.31 
 
 
287 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.11 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  29.03 
 
 
290 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.29 
 
 
970 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  28.18 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>