22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3896 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1415    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2522  hypothetical protein  33.76 
 
 		 487 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694376  normal  0.231254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1981  hypothetical protein  28.62 
 
 		 392 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.40686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  29.61 
 
 		 255 aa  73.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  34.2 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.35 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  29.68 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.07 
 
 		 283 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.07 
 
 		 283 aa  62  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.52 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.65 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.65 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  32.57 
 
 		 289 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  31.43 
 
 		 717 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  34.5 
 
 		 266 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.43 
 
 		 746 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.65 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  22.61 
 
 		 679 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  36.36 
 
 		 263 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  36.36 
 
 		 263 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  26.94 
 
 		 642 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  30 
 
 		 289 aa  43.9  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>