25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1346 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.18 
 
 
1002 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.76 
 
 
1006 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  34.27 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  30.94 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  27.7 
 
 
749 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  30.82 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  27.33 
 
 
746 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  27.33 
 
 
746 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  33.63 
 
 
666 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  25 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.83 
 
 
695 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.22 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.61 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  25.17 
 
 
955 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.12 
 
 
970 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  48.15 
 
 
317 aa  48.9  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.96 
 
 
970 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  25.38 
 
 
717 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  30.23 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  26.76 
 
 
377 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  25.28 
 
 
717 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.92 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.55 
 
 
717 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.25 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>