24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0552 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  72.43 
 
 		 214 aa  293  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  60.61 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  64.29 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  56.19 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  50.79 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.76 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  33.53 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  34.36 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.18 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.25 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.21 
 
 		 599 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.19 
 
 		 717 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  28.33 
 
 		 717 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  24.26 
 
 		 746 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  28.02 
 
 		 289 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  25.48 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  38.71 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.62 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.14 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  39.34 
 
 		 717 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  36.67 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  36.67 
 
 		 263 aa  45.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  32.47 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>