27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4368 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  68.18 
 
 		 220 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  62.31 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  58.59 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  56.19 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.72 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.25 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  31.11 
 
 		 717 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  31.25 
 
 		 717 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  30.17 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  28.65 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  30.34 
 
 		 717 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.16 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  30.69 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  29.94 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  29.94 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  30.85 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.73 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.11 
 
 		 599 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  34.25 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  33.75 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.23 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.11 
 
 		 289 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.48 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  25.38 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  37.5 
 
 		 955 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.25 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>