25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0265 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 214 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  72.43 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  61.93 
 
 		 219 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  59.31 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  57.28 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  47.47 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.47 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  33.72 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.81 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.05 
 
 		 717 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.3 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  28.64 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  29.44 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  30.11 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  28.27 
 
 		 746 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  29.44 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  28.64 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  29.38 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  25 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.25 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  31.17 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.5 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.37 
 
 		 599 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.97 
 
 		 400 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>