23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1688 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  47.6 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  51.34 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  43.72 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  50.79 
 
 		 213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  46.43 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.16 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.95 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.36 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.68 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  24.26 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  30.61 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  27.46 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  25.56 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  27.08 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  29.74 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  26.23 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  26.37 
 
 		 717 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.85 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  26.18 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  26.78 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  25.57 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  25.91 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>