19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1506 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
400 aa  815    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  31.61 
 
 
717 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.9 
 
 
717 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.11 
 
 
283 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.19 
 
 
283 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.28 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.89 
 
 
1002 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  29.34 
 
 
220 aa  49.7  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  28.47 
 
 
314 aa  47  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.25 
 
 
955 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  30.97 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.91 
 
 
1006 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.03 
 
 
717 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  29.03 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.1 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  30.38 
 
 
263 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  30.38 
 
 
263 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>