14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3360 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  90.99 
 
 		 226 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  33.67 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.87 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.5 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  35.71 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.78 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  32.18 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.89 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  44.3 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.5 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.92 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.41 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.72 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>